Базовая кафедра ФОПФ МФТИ в Дубне была создана официально летом 1993 г. с названием "Кафедра физики взаимодействия частиц высоких энергий" , но фактически она существовала в течении трех лет до этого. Как часто бывает в жизни, при создании кафедры тесно переплелись объективные и личные моменты. Объективный момент — старение ОИЯИ и необходимость привлечения талантливой молодежи для участия в перспективных проектах Института. В разное время такими проектами были c-τ фабрика в Дубне, эксперименты на LHC, строительство коллайдера NICA.
Личный момент, существенно способствовавший развитию контактов с МФТИ, состоял в том что сын одного из инициаторов создания кафедры Г.А.Шелкова стал студентом Физтеха. Через "своего представителя на ФОПФ" было существенно проще установить прямые связи со студентами. В незабываемом (тогда) интерьере общежития ФОПФ было проведено несколько неформальных "сходок", в результате чего более половины курса (около 20 человек) подали заявления о переходе на индивидуальный план занятий с базой обучения в Дубне. Было бы преувеличением сказать, что такой массовый "исход" студентов с других кафедр ФОПФ был встречен в деканате с энтузиазмом. Следовало показать всем и себе в том числе, что Дубна может и действительно хочет помочь молодым физтехам войти в современную науку и найти в ней свое достойное место. Это удалось успешно сделать, что и привело к созданию новой кафедры на ФОПФ не только "de facto", но и "de jure".
Прошедшие годы показали, что идея в своей основе состоялась: Институт получил возможность принимать на работу толковых выпускников, а студенты — возможность участия в современных научных исследованиях мирового уровня, практически в любом направлении современной ядерной физики. Прекрасно отдавая себе отчет, что эффективной научная работа может быть только, когда ею занимаются с душой, по любви, а не по принуждению, мы с первых дней пребывания в Дубне призываем и стараемся помочь студентам познакомиться как можно шире со всем спектром научных исследований, ведущихся в ОИЯИ. И, несмотря на название кафедры, не было еще случая, чтобы студенту создавались препятствия занимаются любой другой научной деятельностью в ОИЯИ. Проанализировав итоги деятельности кафедры, можно с радостью отметить, что почти 80% всех выпускников кафедры, успешно завершивших обучение, нашли свое место в науке, и половина из них — в ОИЯИ.
В 2007 году была заметно расширена программа теоретической подготовки, и появилось отделение теоретической физики. Сама кафедра стала называться "Кафедра фундаментальных и прикладных проблем физики микромира". В феврале 2008 года открылось постоянное представительство кафедры в МФТИ.
В заключение хочется отметить, что если уж заниматься фундаментальной наукой, то лучше всего начинать это делать в научном центре мирового уровня. И международный научный центр — Объединенный институт ядерных исследований — одно из лучших для этого мест.